Рас­ста­вим знаки пре­пи­на­ния.

Аб­со­лют­ная ти­ши­на ца­ри­ла в(1)_ ка­зав­шей­ся пу­стой и без­люд­ной(2)_ квар­ти­ре, но(3)_ когда мы про­шли в ка­би­нет, то с удив­ле­ни­ем уви­де­ли там и Алек­сея Бо­ри­со­ви­ча,(4)_ и его уче­ни­ка,(5)_ и нашу со­сед­ку Аглаю.

1)  и 2) за­пя­тые не нужны, т. к. при­част­ный обо­рот стоит перед опре­де­ля­е­мым сло­вом

3)  за­пя­тая не нужна, т. к. не­воз­мож­но изъ­ять или пе­ре­ста­вить при­да­точ­ную часть, а также есть вто­рая часть союза  — «то»

4)  5) за­пя­тые между од­но­род­ны­ми, свя­зан­ны­ми по­вто­ря­ю­щим­ся со­ю­зом.

Ответ: 45.